Nova metoda genetske analize često otkriva abnormalnosti fetusa

Genetska analiza pomoću DNK Microarrays daje mnogo bolje rezultate u prenatalnog probira nego tradicionalne metode karyotyping.

sadržaj

Dnk nizovi - budućnost prenatalni probir
Koristeći novu metodu u porodu
Pro i kontra od nove metode

Ovaj zaključak je bio američki znanstvenici.

U velikom kohortnog istraživanja, utvrđeno je da su DNA nizovi mogu otkriti klinički značajne abnormalnosti koje nisu mogle biti identificirane u 6% karyotyping fetalne DNA uzorke sa strukturnim oštećenjima, a 1,7% uzoraka koji su uzeti u svezi s majčine dobi i sumnjivi rezultati probira. To je rekao dr Ronald Uopner s Columbia University Medical Center u prosinačkom izdanju New England Journal of Medicine.

Ova studija je bio jedan od tri objavljenih radova, da u odnosu na novu metodu analize i karyotyping za različite dijagnostičke svrhe.

Uopner doktor i njegovi kolege tvrde da su njihovi podaci pokazali DNA microarray prednost kao standardna komponenta prenatalnog probira. Ova metoda pomaže identificirati više genetskih abnormalnosti od zastarjelog načina karyotyping.

Dr. Alexander Radzhkovits, genetičar sa Sveučilišta Pittsburgh Medical Center, koji nije bio uključen u ove studije, rekao je u intervjuu online izdanju "MedPage Danas&rdquo-, da su mnogi američki liječnici već su se prebacili na novi način u prenatalnog probira.

Dr Radzhkovits napomenuti da je ova metoda, po njegovom mišljenju, je povijesni trenutak u razvoju genetske analize u posljednjih nekoliko godina.

DNK nizovi - budućnost prenatalni probir

Karyotyping koristi za prenatalnu dijagnostiku genetskih bolesti još od 1960. Ova metoda je za proučavanje žive stanice pod mikroskopom za otkrivanje abnormalnosti u strukturi kromosoma.

DNK nizovi, s druge strane, pružaju mogućnost detaljnog proučavanja DNA, uključujući identifikaciju nestalih ili dodatnih malih fragmenata. A karyotyping ne dopušta da se u obzir dijelova DNA najmanje 3 milijuna parova baza genetičkih čips može otkriti anomalije u veličini fragmenata, nekoliko kilobaza.

Doista, danas, DNK nizovi se preporučuje kao prva linija dijagnostički test za potvrdu razvojne abnormalnosti i strukturalne nedostatke u male djece. Ali vrlo malo klinička ispitivanja provedena su ispitati učinkovitost ove metode u prenatalnog probira za identifikaciju genetske bolesti kod fetusa prije njegovog rođenja.

Dr Uopner i njegovi kolege pokrenuo veliki studiju. To uključuje 4.406 žene koje su prenatalno genetsko testiranje raznih razloga, uključujući dob majke, nedefiniran rezultat probira za Downov sindrom, fetalni strukturne abnormalnosti na ultrazvuk.

Svaki uzeti uzorak podijeljen je u dva dijela, a testirani su postupkom iz karyotyping metodu i DNA microarrays.

Istraživači su otkrili da mikročipovi su u stanju prepoznati sve aneuploidan i neuravnotežene preuređenja koje su vidljive kada karyotyping. No, mikročipovi nisu pokazali bolesti, koje su vidljive na većoj razini kromosomske, uključujući uravnotežen translokacije i triploids. Međutim, nova tehnologija omogućuje lakše otkriti greške na razini pojedinih gena.

U 3,4% uzoraka otkrivene su promjene koje imaju nesiguran kliničku vrijednosnoj od kojih je 72,3% su benigni, a drugi - patogenog. Zabrinutost zbog neizvjesnih rezultata screeninga je da su od velike važnosti za bolesnike, često neopravdano.

Dr Radzhkovits kaže majka nesigurna ishod trudnoće je jedan od najvećih strahova i stresa. Ovdje u ovom trenutku i osjetio svu važnost nadležnog genetičkog savjetovanja kao profesionalni tumači rezultate testa za zabrinutih roditelja i daje im najviše točne preporuke.

Koristeći novu metodu u porodu

U drugoj studiji, dr Uma Reddy Nacionalnog instituta za zdravlje djece i ljudski razvoj je utvrdio da je testirate pomoću DNK mikronizovima daje bolje rezultate u genetskoj dijagnostici uzroka mrtvorođenja.

Istraživači vjeruju da je 6 do 13% mrtvorođene djece zbog fetalnih genetske abnormalnosti, ali učestalost tih anomalija može biti veća. Mikročipovi pomoći identificirati takvih slučajeva i to ne zahtijeva prisutnost živih stanica - veliku prednost.

Dr. Reddy i njezin tim proučavali uzorke DNK od 532 mrtvorođene djece kako bi se pronašli genetske abnormalnosti. Otkrili su da su DNA mikročipovi češće daje rezultate nego karyotyping (87,5% u odnosu na 70,5%, P<0.001).

Ovaj postupak pokazao se pouzdanim u otkrivanju aneuploidiju (8,3% prema 5,8%, p = 0,007), što pokazuje učinkovitost 41,9% (omjeru detekciju frekvencije 1,42- 95% CI 1.07 prema 1,89 ). Mikročipovima više genetske abnormalnosti otkriven u specifičnim podskupinama, uključujući 443 slučajeva prenatalnog porodu (8,8% prema 6,5%, p = 0,02) i kod 67 slučajevima s defektima u porodu razvoja (29,9% u odnosu na 19,4%; P = 0,008).

Kao iu prethodnom istraživanju, mikročipovima identificirati više abnormalnosti s neizvjesnim kliničkog značaja nego karyotyping metodu. No, znanstvenici su zaključili da ona može biti korisna u nekim slučajevima.

Drugi izvještaj stranica, istraživači su usmjerena na genetski poremećaj naziva naboj, koji nije fiksna bilo prenatalno ultrazvukom ili karyotyping ili DNA microarray.

Dr. Cynthia Morton i njezini kolege s Harvarda su koristili potpunu genomske sekvenciranje dijagnosticirati ovu bolest tijekom prenatalnog analize. Kao rezultat toga, oni su mogli utvrditi točan točku izgon genetskog materijala. nađeno ih na 8q12.2 u CHD7 gena (locus naboja patogene sindrom), kao i u 6q13 LMBRD1 gena (locus patogeni recesivni metabolički poremećaj vitamina B12).

Dr. Kim McBride iz Centra za molekularnu genetiku u dječjoj bolnici u Columbusu (Ohio, SAD), nije uključen u studiju, rekao je da izvješće sadrži zanimljivu primjenu novih tehnologija. Dodao je da je impresioniran činjenicom da su znanstvenici bili u stanju izvući DNK uzorak, pripremiti ga u potpunosti analizirati i napraviti izvješće u samo 2 tjedna. Dr McBride nije siguran da je ova metoda će biti proslijeđeni u kliničkoj praksi, ali je jedinstven u nekim slučajevima.

Pro i kontra od nove metode

Dr. Lorraine Dugoff University of Pennsylvania istaknuo da je nova studija otkriva svu „snagu, složenost i neočekivane zamke povezane s primjenom novih tehnologija u kliničkoj praksi.”

Istaknula je da je glavni nedostatak nove metode je nemogućnost interpretirati kliničko značenje nove, do sada nepoznate varijante genetskih abnormalnosti. Dakle, znanstvenici će biti novi izazov - razviti veliku bazu nepoznatih genetskih abnormalnosti ih povezati s određenim patološkim stanjima i shvatiti koji od njih nemaju klinički značaj.

Dr McBride je u nadi da su nove genetske varijante katalozima, broj nepoznatih podataka će se brzo otopiti.

U Sjedinjenim Američkim Državama, analiza pomoću genetskih proizvedenog niza dostupnih za oko istu cijenu kao karyotyping. Nova analiza vrijedi 1,500-2,000 $ u odnosu na 1,000-1,500 $ za karyotyping. Međutim, obje metode zahtijevaju invazivne postupke za uzimanje genetskog materijala, koji je povezan s malim rizikom od pobačaja.

Studije dr Uopnera i dr Reddy je provedeno uz pomoć dječje zdravlje i ljudski razvoj Nacionalnog instituta (NICHD). Svi ovi nizovi i reagensi su osigurale Agilent Technologies i Affymetrix.

Dijelite na društvenim mrežama:

Povezan